KURUMUN TARİHÇESİ :
Lapseki'de İmam-Hatip Ortaokulunun açılması, Çanakkale İl Milli Eğitim Müdürlüğünün 25.06.2012 tarih ve 100/010702 sayılı yazıları ile Valilik Makamına teklif edilmiş, Valilik Makamının 28.06.2012 tarihli oluru ile Lapseki 25 Eylül İlkokuluna ait (Halk Eğitim Merkezi Müdürlüğüne tahsisli) binada açılmış ve 2012-2013 ders yılında eğitim-öğretime başlamıştır.
Lapseki ilçesi Şahinli Köyünden 26 yaşındaki Astsubay Hüseyin ÇETİN, görev esnasında Hakkari´ nin Şemdinli İlçesinde askeri konvoyun geçişi sırasında yola döşenen bombanın patlaması sonucu 23 Ağustos tarihinde şehit olmuştur. Bu şehidimizin ismi daima hatırlansın diye "Lapseki İmam-Hatip Ortaokulu"nun ismi Çanakkale Valiliğinin 18.10.2012 tarih 1774 nolu oluruyla "Şehit Hüseyin Çetin İmam-Hatip Ortaokulu" olarak değiştirilmiştir.